まだ見ぬ壁外の世界を夢見る10歳の少年、エレン･イェーガー。エレンは仮初めの平和に満足し外の世界へ出ることを諦めた人々に違和感を覚える。 彼らを「家畜」と呼ぶエレン。エレンを「異物」と感じる人々。だが、壁をも越える超大型巨人の出現により、エレンの「夢」も人々の「平和」も 突如として崩れ去ってしまう･･･。

頭には、「かすみそう」。お父さんの頭には、「ひまわり」。お母さんの頭には、「たんぽぽ」。そして、はなかっぱには、「とりあえずの花」が咲いています。大人になるまで、いろいろな花を咲かせるのです。
はなかっぱが咲かせる花の中でも、若返りの花と伝えられる「わか蘭（らん）」を狙って、黒羽屋蝶兵衛（くろはねやちょうべえ）一味がやってきます。いつも、やまびこ村はてんやわんやの大さわぎ！
さてさて、今日はどんな花が咲くのでしょうか？はたして、「わか蘭（らん）」は咲くのでしょうか？そして、はなかっぱは、どんな花を“自分の花”に決めるのでしょう。

しかし、新たな“闇”は動き始め、“運命の時”を引き寄せる──!!!